急性上呼吸道感染根据鼻咽部症状和体征结合周围血象和阴性的胸部x线检查可做出临床诊断，一般无需病因诊断，特殊情况下可进行细菌培养和病毒分离或病毒血清学检查等确定病原体，但需要与初期表现为感冒样症状的其他疾病鉴别。
比如：
1、过敏性鼻炎，起病较急，常表现为鼻粘膜充血和分泌物增多，伴有突发连续喷嚏、鼻痒、鼻塞和大量清涕，无发热、咳嗽较少。多由过敏因素如螨虫、灰尘、动物毛发、低温等刺激引起，如脱离过敏原数分钟至1到2小时内症状即可消失。
2、流行性感冒，为流感病毒引起，可散发，有时有小规模流行，病毒发生变异时，可大规模爆发。起病急，鼻咽部症状较轻，但全身症状较重，伴高热全身酸痛和眼结膜炎等症状。取患者鼻清洗液中粘膜上皮细胞涂片，免疫荧光标记的流感病毒免疫血清染色，致荧光显微镜下检查有助于诊断。
3、急性气管支气管炎，表现为咳嗽、咳痰，血白细胞可升高。鼻部症状较轻，x线胸片常见肺纹理，增强。
4、急性传染病前驱症状。很多病毒感染性疾病，如麻疹。脊髓灰质炎、脑炎、肝炎和心肌炎等疾病前期表现类似。初期可有鼻塞头痛等类似症状，应予以重视。但如果在一周内呼吸道症状减轻，反而出现新的症状，需进行必要的实验室检查以免误诊。