脑血栓形成和脑栓塞的主要不同点，就是在于血栓栓子的来源不同。
对于脑栓塞患者其血栓常来自于心脏，因为心房颤动会导致心脏内形成血栓，同时纤维素骨架也是以白色的血栓比较多见，对于这类脑栓塞患者，一般用普通的溶栓药物进行治疗，整体效果都不会太理想。
脑血栓的致病血栓都是属于受损血管局部位置的，而且主要是以红色的红细胞血栓居多，在治疗过程当中使用溶栓类药物就能够取得不错的效果，相对来说更加的容易被治疗。所以在临床上诊断时，需要先分清楚是血栓形成，还是脑栓塞，然后再采用相应的方式进行治疗。