胆囊萎缩一般不会引起肝功能异常。
如果发现有肝功能异常时，建议及时到医院就诊，完善肝胆彩超、肿瘤标志物等相关检查，明确胆管内有无结石，以及肝脏有无发生病变。胆囊萎缩通常合并有胆囊结石，胆囊失去浓缩储存胆汁的功能，如果没有明确的手术禁忌证，建议及早行手术切除胆囊，因胆囊在胆囊内反复刺激胆囊壁，有可能会引起胆囊发生恶变。
胆囊内的小结石也有可能会通过胆囊管进入胆总管内，而引起黄疸或者肝功能异常，此时在胆囊切除手术过程中去探查胆囊管。