巨幼细胞贫血主要有血液系统表现、消化系统表现、以及神经系统表现和精神症状三个大方面的临床表现。
其中血液系统表现主要为起病缓慢，常有面色苍白、乏力、耐力下降、头晕、头昏、心悸等贫血症状，重者全血细胞减少，反复感染和出血，少数患者可出现轻度黄疸。
消化系统表现主要有口腔粘膜、舌乳头萎缩、舌面呈“牛肉样舌”可伴舌痛，胃肠道粘膜萎缩可引起食欲不振、恶心、腹胀、腹泻或便秘。
神经系统表现和精神症状有对称性远端肢体麻木、深感觉障碍、共济失调或步态不稳，味觉、嗅觉降低，锥体束征阳性、肌张力增加、腱反射亢进，视力下降、黑蒙症，重者可有大小便失禁，叶酸缺乏者有易怒、妄想等精神症状，维生素b12缺乏者有抑郁、失眠、记忆力下降、谵妄、幻觉、妄想甚至精神错乱、人格变态等。