消化道溃疡的诊断最好是做胃镜，消化性溃疡的诊断不能通过症状和体征来确诊，需要利用仪器检查。
胃镜检查是消化性溃疡最重要的常规检查，除胃镜检查外还可进行上消化道钡餐透视或胃肠道超声检查，但上消化道钡餐造影和超声造影的准确性不如胃镜，因为胃镜能直观地观察消化性溃疡，观察溃疡的部位和大小，结合胃镜下病理活检，可区分消化性溃疡的良恶性。
此外，还需要胃镜检查来评估治疗后，消化性溃疡的复查情况，以确定消化性溃疡是否治愈。