直肠炎是可以通过中药来治疗的，以口服和灌肠治疗为主要治疗方式​。
可咨询医生通过把脉辩证结合患者临床症状，选择柴胡疏肝散、失笑散等中成药物，脾胃湿热的可采用芍药汤、葛根芩连汤。灌肠的中药大多选择黄芩、黄柏、苦参、土茯苓等组成中草药汤剂灌肠，可以对肠道有抗炎作用，对溃烂起到修复的功效。
结肠炎患者在中药治疗期间要忌辛辣、油腻的食物，以清淡的各种粥类，比如小米粥、肉片粥、瘦肉粥等饮食为主​。