任何能引起胆汁成分改变的因素，理论上都可以产生结石，临床上最常见的原因为感染，包括肝炎，或者其他部位细菌的侵犯等，炎症细胞刺激胆汁，造成胆汁中的结晶成分析出，最终形成结石，肝内胆汁郁积症也是常见的诱发因素。
除此之外，个别地区和种族的居民、女性激素、肥胖、妊娠、高脂肪饮食、长期肠外营养、糖尿病、高脂血症、胃切除或胃肠吻合手术后，回肠末段疾病和回肠切除术后肝硬化、溶血性贫血等因素，都可引起胆结石。
在我国西北地区的胆囊结石发病率相对较高，可能与饮食习惯有关。