喝完咖啡后肚子咕咕叫，是因为咖啡中的咖啡因和生物碱刺激胃肠道，胃肠功能出现紊乱，引起肠道蠕动过快，出现肚子咕咕叫，并可能伴有拉肚子。
特别存在有慢性胃炎、胃溃疡的人群，因为胃部的黏膜保护屏障受到了破坏。如果空腹时喝咖啡，对胃部黏膜和肠道刺激更大，从而出现肚子咕咕叫、腹泻，严重的还会引起恶心、呕吐。
若伴有腹泻，需服用止泻药物、促进胃动力的药物，比如蒙脱石散、吗丁啉。饮食要暂时吃流质、半流质的食物，减轻胃肠道的负担。