低颅压性头痛的症状，主要是头痛发生在坐位或者是站立的时候，还可能伴有恶心、呕吐。如果在这时候平卧休息，这些症状就会很快地缓解。
低颅压性头痛可能发生在腰椎穿刺后1~2天。头痛一般是发生在双侧头部的枕部、额部，也有可能会扩展到整个头部。在用力咳嗽、打喷嚏、摇头时也可能会诱发头痛。这可能是因为硬膜外腰椎穿刺后，脑脊液流出导致脑脊液容量减少。
还有一些低颅压性的头痛，找不到明确的病因，称为自发性的低颅压导致的头痛。这类患者除了头痛之外，还可能会有恶心、呕吐，脖子僵硬、疼痛、耳部闷胀感、耳鸣、眩晕的症状。