胆囊癌患者的用药原则是针对症状和病因联合用药。比如胆囊癌的患者可造成梗阻性黄疸，也可能造成肝功能的损害。
大部分患者有合并胆囊炎症的表现，若胆囊癌患者临床出现胆汁流动不畅，消化功能不良、周身黄疸等症状，需对消化系统进行药物支持治疗。如消炎利胆片、熊去氧胆酸、伊托必利分散片、茵栀黄颗粒等，均可促进胆汁流通。
针对胆囊的恶性肿瘤，需要选择相应的化疗药物，临床上常见的包括吉西他滨、顺铂、5FU、卡培他滨等。对于胆囊癌患者来说，手术是根治性治疗的唯一手段，药物多为辅助作用。