胆管肿瘤可以做微创手术，其手术主要通过腹腔镜。在胆管肿瘤手术前，需要充分进行术前评估、麻醉及手术的耐受性，并初步判断肿瘤的性质。
如果为恶性者，需要通过相关辅助检查，以评估其临床分期、肿瘤的具体部位，确定能否行根治性手术治疗。
胆管肿瘤以恶性肿瘤多见，并且胆管肿瘤对于放化疗不敏感。因此，对于胆管肿瘤手术是治愈的仅有机会和主要方法，手术方式需要根据肿瘤存在的具体部位以及分期决定。如果肿瘤已经发生远处转移，失去手术机会，只能行姑息性治疗。