肛周脓肿根治术后，有的还会形成肛瘘。
肛周脓肿和肛瘘是同一个疾病的两个不同发展阶段，早期为肛周脓肿，肛周脓肿破溃或切开引流后，后期形成肛瘘。
肛周脓肿来源于肛管内肛腺感染，也就是肛瘘内口，如果肛周脓肿只做切开引流术，没有处理原发内口，术后一定会形成肛瘘。如果肛周脓肿做了根治术，处理了内口，一般不会形成肛瘘，有少部分术后形成肛瘘了，可能是术后换药不及时，形成了假愈合，也就是创面皮肤先愈合了，创面底部脓腔处又形成了瘘管，导致再次形成肛瘘。