肛周脓肿破了还是需要手术治疗，但手术时机的选择需要结合破口的大小以及脓腔引流通畅程度。
如果肛周脓肿虽然破了，但是局部红肿、疼痛症状仍然比较严重，说明虽然脓腔破了，但脓腔内的脓液引流并不通畅，这种情况下患者还是需要及时去医院手术治疗，需要将破口扩大并且要保证脓腔引流通畅，二期形成肛瘘以后再行肛瘘根治性手术或者直接行脓肿根治术。
而如果肛周脓肿破了，局部症状迅速消失，说明脓腔引流相对通畅，患者可以在三个月以后形成肛瘘再行手术治疗。