肛周脓肿会造成肛瘘。在临床上肛周脓肿大多数转归成肛瘘，很少自愈或者经过手术后痊愈。
首先肛周脓肿形成的原因是肛隐窝感染，蔓延波及到肛门直肠周围间隙形成脓肿，分为肛周皮下脓肿、坐骨直肠窝脓肿、直肠黏膜下脓肿和括约肌间脓肿，依据脓肿的位置，临床症状略有不同。
深部脓肿涉及到组织器官多，多出现全身症状。治疗上多采用切开引流术，切开脓肿彻底引流，同时清除坏死组织。术后形成肛瘘，比例可达70%，较少病例可以实施一次性根治，达到根治的目的。