足舟骨骨折可能会留有后遗症。主要患者没有积极地配合医生进行治疗，或者护理不当，有可能会导致骨折部位出现畸形愈合，或者是不愈合的情况，就会使患者出现疼痛等症状，从而影响到患者日常的行走和站立。
如果在恢复的过程当中，患者缺乏锻炼，患肢长期不进行活动，可能会引起肌肉萎缩、关节僵硬等后遗症。但是，通过积极的锻炼后，通常能够逐渐地恢复正常。
因此，在恢复过程当中，患者一定要做好各方面的护理，注意患肢的保护，适当地进行局部的功能锻炼，合理膳食，避免出现后遗症。