新生儿高胆红素血症有很多的危害，其中新生儿胆红素脑病是新生儿高胆红素血症最严重的并发症。严重的情况下，甚至可以引起新生儿死亡。因此远超生理剂量胆红素，对新生儿脑神经的影响，一定要提高足够的警惕。
另外，高胆红血症也会引起听力损伤，进入血脑屏障后，胆红素是可以引起新生儿听力损伤的。
第三，新生儿高胆红素血症可能会导致肾脏的损伤，还可以影响心功能的损害，以及牙齿的发育异常。这些都是新生儿高胆红血症的一些危害。