肝血管瘤的病因，首先考虑到是由于先天性发育异常而导致。
因为目前临床上认为肝血管瘤属于先天性疾病的一种。在胚胎发育过程中，如果肝血管发育出现一定的异常，就有可能会导致血管内皮细胞出现异常增生，肝脏末梢的血管扩张会呈现畸形的状态，进而就会形成局部的血管瘤。
已有部分研究表明，激素紊乱也是重要的致病因素，部分女性长期口服避孕药，也可能会导致血管瘤变大。所以，一旦确诊需根据自身的情况，采用手术疗法进行治疗。