绝大多数的毛细胆管炎，通过早期正规有效的治疗，病情都能够得到改善或治愈。目前对于胆管炎的治疗，一般根据临床症状进行对症处理。
胆管炎的急性发作期，一般采用禁食、胃肠减压、输液、抗感染等综合治疗。配合利用解痉、镇痛和利胆药物，其中50%硫酸镁溶液常有较好的效果。
虽在胆管梗阻时胆汁中的抗生素浓度不能达到治疗所需浓度，但大剂量广谱抗生素的联合应用能有效治疗菌血症和败血症。如果保守治疗无效，就需要根据病情选择手术治疗。