手术活检能判断是否为骨髓炎。通过手术活检可以做细菌培养，然后将标本培养的结果用来判断是否患有骨髓炎，这种做法比较可靠。
除了通过手术活检来判断骨髓炎以外，还可以通过实验室检查来进行判断，比如白细胞计数正常，但是C-反应蛋白和ESR升高，很可能就是骨髓炎所致。
也可以通过X线检查来进行判断，因为在感染后的3-4周，骨质会出现不规则的硬化和增厚表现。如果X线检查不明显，可以做CT检查，能明确病变骨和椎旁脓肿，但对于是否存在感染的情况往往无法区别。