胆总管囊肿会引起黄疸，由于囊肿的存在可能会引起胆总管出现不同程度的扩张，胆汁淤积胆汁此时逆行入血而引起黄疸。
胆总管囊肿还有可能会出现右上腹部疼痛不适以及如果囊肿较大时，还会在腹部摸到有肿块的存在，胆总管囊肿将会引起一系列复杂病变，并最终引起一些较严重的并发症，如胆汁性肝硬化、胆管癌等。
通过腹部彩超检查可发现囊肿的存在，如需确诊需进一步完善腹部增强CT、胆道造影等相关检查，在明确诊断胆总管囊肿后，需根据具体哪种的类型积极早期手术治疗。