射精的时候出现尿道疼痛，有可能是属于尿道炎或者是由于精囊炎、前列腺炎等实质性的泌尿系统感染因素所导致的。
所以应该先禁止进行性行为，多喝热水腹部热敷，同时还应该检查一下前列腺B超、尿常规、精液常规、血常规检查等辅助检查。通过以上检查结果，确诊是哪一个器官的病变，及时选择敏感的抗菌药物进行控制感染对症治疗，待炎症消退之后，尿道痛的症状就会逐渐恢复。
平时应该注意性生活方面要有节制，避免进行过度的性行为，此外还应该戒除手淫，多参加一些体育锻炼、增强体质。