射精时刺痛，多考虑可能与精囊炎有关。该病不仅可导致患者在射精时出现刺痛感，同时还可伴有会阴部疼痛不适、尿痛、尿急，以及尿频等表现。严重者还可伴有发热、寒战，以及血精等表现。
也可能为精囊周围的一些器质性病变所引起，常见于尿道狭窄、附睾炎、前列腺结石，以及前列腺炎等，都可能造成患者在射精时刺痛。比如患有前列腺结石疾病，在射精时尿道也会产生明显收缩动作，这时就很可能会刺激到结石，进而引起射精时刺痛，实际上是结石对前列腺部位的黏膜产生刺激所引起。
因此，出现射精刺痛症状时，应及时就诊，确定病因后，对症采取治疗措施。