肛瘘手术复发率不高。肛瘘目前治疗的方法，主要是通过手术切除瘘道的方式处理，手术也分为很多种，根据病情的情况决定手术的方式和类型。
如果手术过程中彻底清除瘘道，一般是不会引起复发等情况。如果有瘘道残留等情况会引起复发的表现，同时，后期也需要定期的换药，防止发生假愈合引起肛瘘复发。
饮食方面主要是以清淡饮食为主，不要吃辛辣、刺激的食物。保持良好的饮食及排便习惯，注意休息，增加机体抵抗能力。保持大便的通畅，排便后清洗肛门，注意定期的复查。