胆囊结石引起的疼痛有多方面，首先大部分胆囊结石可以活动。在石头活动的时候会刺激到胆囊黏膜，引起胆囊痉挛性疼痛，胆囊结石还可以堵塞胆囊颈部，造成胆囊内压力过高，胆囊压力过高会引起持续性的胀痛，临床上大多数的胆囊结石通常很容易诱发胆囊炎，炎症可以刺激到胆囊粘膜的神经，造成胆囊痉挛或抽搐，引起疼痛。
另外吃饭时，尤其是进食大量油腻食物，会造成胆囊收缩，在这一过程中胆囊粘膜与胆结石的接触次数会增多，造成疼痛加重。