临床上，胰腺结石多继发于长期的慢性胰腺炎之后，胰腺结石最主要的诱发因素是嗜酒，长期大量饮酒，这些会导致胰腺胰液的成分发生改变。胰液成分发生改变之后，会形成蛋白栓，另外胰液中的钙反应，最后形成胰腺的结石。
除此之外，创伤、胆道系统的炎症、胃肠道的炎症，都是胰腺炎的诱发因素，也是导致胰腺结石最常见的病因。胆道下端恶性肿瘤、胰头部的癌症、胰腺的囊肿，都可以阻塞胆管，造成胰液排出不畅，最终形成胰腺结石。