功能性消化不良是会引起腹泻的。功能性消化不良，主要是由于胃动力不足、消化液分泌缺乏，食物进入胃中不能完全消化，就排入肠道，刺激肠壁导致蠕动增快引起腹泻；还会伴有上腹胀、早饱、恶心、呕吐、食欲下降、肠鸣、排气量多等症状。
排出的粪便中，存在没有完全消化的食物残渣，影响对食物营养的吸收；通常与饮食过多难消化的食物、饮食没有规律、暴饮暴食所导致的；可以服用多潘立酮、健胃消食片、复合维生素B，促进消化。