胆管结石可以应用抗生素、解痉止痛的药、利胆药物、护肝药物。
胆管结石，长期存在容易诱发胆管炎、胆道梗阻，症状不严重的胆管结石可以应用药物治疗。如果胆管结石引起慢性胆管炎可以针对性地应用抗生素进行治疗，比如头孢他啶、克拉霉素等。
如果引发胆管急性发炎时疼痛较严重，可以给予山莨菪碱、吲哚美辛等解痉止痛的药物，暂时缓解，同时可以给予利胆的药物，比如消炎利胆片，促进胆汁排泄。
如果出现肝功能异常的患者，可以酌情使用护肝的药物，比如还原型谷胱甘肽，药物治疗胆管结石只能缓解病情，此病还要手术治疗为主。