孕妇做核磁共振检查是否会影响到胎儿，主要是看怀孕的时间。
怀孕3个月以内的孕妇，由于胎儿的各脏器发育还没有完全成熟，此时做核磁共振检查有可能会对胎儿有一定的影响。所以怀孕3个月以内的孕妇不能够做核磁共振检查。但是怀孕3个月以后的孕妇可以做核磁共振检查，不会对胎儿产生不良的影响。
但是一般情况下，也不会随意让孕妇做核磁共振检查，只有当超声或者是血液等其他的检查方式，无法对患者或者是胎儿进行相应诊断的时候，才会选择孕妇做核磁共振检查。此时，医生会权衡利弊，为患者考虑。