核磁共振没有辐射，运用到产前检查，是一项比较新的辅助检查手段手段。但孕妇做核磁共振还需要选对时间，通常认为胎儿器官形成阶段，妊娠前12周的胎儿对核磁共振期间的噪音和热量很敏感，有一定影响，不宜做核磁共振检查。
一般认为28周以前，做核磁共振的效果没有超声检查好，28周后胎儿各个器官，都能在核磁共振下很好的显像。
同时胎儿头部骨骼钙化后，超声不能清楚观察胎儿头部的变化，此时核磁共振是最好的检查胎儿头部的方法。