乙肝小三阳患者一般早上起床是不会出现全身疼痛症状的。
乙肝小三阳如果是急性乙型病毒性肝炎，患者一般会有乏力、恶心、呕吐、发热、食欲下降等症状。这时患者会出现肝功能的异常，需要保肝对症治疗。如果乙肝小三阳的患者是慢性乙型病毒性肝炎，患者在肝炎病毒稳定没有活动的时候，患者可以没有任何的症状，也不会出现晨起全身疼痛。当患者的慢性乙型病毒性肝炎有肝炎持续活动，患者会有乏力、周身不适、厌油、恶心等消化道症状，这时，患者需要保肝对症治疗，及进行抗病毒治疗。
如果乙肝小三阳的患者发展为肝癌，肝癌有累及及转移的情况，可能会出现局部的疼痛。