反流性胆管炎由肠道内细菌逆行感染而致。除胆肠内瘘外，胆肠吻合术后肠内容物逆流进入胆道系统是最常见原因。在Oddi括约肌切开术后也可发生，特别是在胆道放置大直径的金属支架者。
一般情况下，反流性胆管炎经过积极有效的治疗后，病情都能够得到极大的改善或治愈。但是如果不经过治疗，想通过机体的自愈达到消除病情的可能极小。
目前临床上对该病的治疗以消炎利胆为原则，如果引起相应的症状时，则需要进行对症处理。反流性胆管炎由于病因不同，部分患者需要进行手术才能治愈。