第一，半夜肩膀疼醒最常见的原因是肩周炎。肩周炎的最典型症状是夜间痛，夜间时往往会出现明显的疼痛，而白天会有所减轻，肩膀不能够受压。这时要早期地进行查体以及检查，来早期地诊断肩周炎，早期地进行相关的止痛，以及肩关节的功能锻炼，来防止肩关节僵硬。
第二，其他的原因包括肌筋膜炎，肌筋膜炎常可以导致肩胛骨内侧的疼痛，可以放射到同侧的上肢。在夜间时疼痛比较明显，可以出现在着凉、劳累之后明显的疼痛。
第三，原因可能是颈椎病，而导致颈椎病压迫神经，严重时也可以在晚上睡觉姿势不正确时，神经受压加重而导致肩膀疼痛加重，可以有疼醒的症状。