多发性肝囊肿是良性疾病，可药物治疗和手术治疗。
多发性肝囊肿是因为胆管上皮细胞分化的肝囊肿，取代了肝组织，损害肝细胞的结构和功能，最终形成了囊肿。如果没有临床任何症状，囊肿不大的，可以暂时定期复查、观察不用特殊治疗。如果囊肿的直径比较大，对周围的脏器造成压迫或者出现腹痛、腹胀等不适症状，这种情况需要进行手术治疗。
临床主要采取腹腔镜下行肝囊肿开窗引流术或者穿刺引流术治疗，术后注意饮食要清淡，避免油腻、高脂肪的食物。