甲状舌囊肿及瘘管用药原则是要严格按照医嘱坚持足量、足疗程用药，切不可私自调整药物的用量，以免影响治疗效果，如果服药期间，出现不良反应，应立即停药，及早就医。
甲状舌囊肿及瘘管在术后医生通常会要求进行服药，服用的药物主要是消炎药，目的是预防感染；甲状舌囊肿及瘘管术后预防感染是很重要的，感染会直接影响伤口的愈合，导致伤口迁延不愈，不但会给患者带来痛苦，而且还会影响正常工作和生活。
因此在术后一定要严格进行服药，在术后半个月左右可到医院进行复查，根据医嘱决定停药或者继续用药。