甲状舌囊肿及瘘管的预防主要是在母亲的妊娠期尽量避免接触对胎儿不利的因素，比如吸烟、酗酒、长期暴露在辐射之中、滥用药物等，在孩子出生后家长应尽量避免孩子接触对咽部有刺激的东西。
甲状舌囊肿及瘘管主要是由于在胚胎发育的第八周甲状舌管未完全退化造成的，不但会导致患者出现喉咙部位红肿疼痛的情况，而且还会有粘稠液体分泌排出。
一旦确诊后，应及早进行手术切除，并联合进行抗感染治疗。如果不及时治疗，甲状舌囊肿及瘘管很有可能会发生癌变，不但会增加治疗难度，还会严重的降低患者的生活质量，因此及早治疗是关键。