反流性胆管炎主要是以消炎利胆为主，并根据实际的临床症状做出对症治疗。比如，反流性胆管炎最常见的症状包括反复发作的寒颤、高热和右上腹疼，部分患者会出现黄疸。
除了常规应用抗生素控制感染外，当疼痛发作时可以给予解痉止痛等药物，如间苯三酚、6542；如果出现寒颤、高热时可以给予降温药物，如复方氨林巴比妥、吲哚美辛栓；如果出现黄疸需要给予保肝、降黄等药物，如熊去氧胆酸、茵栀黄颗粒等等。
但是大部分通过保守治疗的患者病情不能根治，需要通过手术方法治疗。