膝关节炎可能会导致腘窝囊肿，主要见于半月板损伤或者退行性变因素所导致的膝关节炎。因为这些因素会导致关节内的积液增多，当积液增多以后，会使关节腔内的压力逐渐增加，关节囊在受到压迫以后就容易向薄弱的地方突出，从而形成腘窝囊肿。
在出现腘窝囊肿的情况后，可以通过局部注射皮质类固醇药物予以缓解，能够减轻局部的粘连，消除囊肿。
对于比较严重的腘窝囊肿，可进行手术治疗，比如传统囊肿切除术或者是关节镜手术，在手术后大多数患者预后较好。