肝胆管结石分为肝内胆管结石和肝外胆管结石。肝内胆管结石的患者，如果没有明显的临床症状，辅助检查也没有黄疸的提高和肝功的损害。这种情况下是可以通过保守治疗，定期的观察和随诊就行了。
但是，如果肝内胆管结石的患者出现了肝区的疼痛，并有发热、腹胀、乏力、食欲不振，恶心呕吐等临床表现，就需要做手术了。手术方式根据结石的大小和数量而定，包括胆管切开取石和肝部分切除。
对于肝外胆管结石，由于胆管较窄，因此除非结石很小，否则都有可能造成梗阻。所以肝外胆管结石患者首选手术，常用的手术方式包括内镜下取石和胆管切开取石等。