临床上最多引起胆汁酸升高的原因是肝胆系统的疾病，常见的有急慢性的乙型病毒性肝炎、肝硬化、脂肪肝、酒精肝等。对于这样的患者，如果伴有其他肝功能指标明显的升高，还应当应用保肝、护肝的药物，比如复方甘草酸苷片，同时还应当避免饮酒以及进食高脂油腻的食物。
对于由于胃、十二指肠溃疡和结肠炎引起的患者，首先应当注意饮食的规律，避免进食生冷、油腻、辛辣等刺激性食物。同时还可以考虑口服胃黏膜的药物，比如奥美拉唑和铝碳酸镁等。如果合并有幽门螺杆菌感染，还需要应用抗菌药物联合根治性的治疗，比如阿莫西林和奥硝唑等。