胆囊癌有一定的遗传特性。临床研究发现，胆囊癌的患者有一部分具有家族聚集史，但是具体的遗传机制尚不完全清楚。
目前已知的原因，是胆固醇ATP结合和转运G5、G8调控基因变异，是胆囊癌最常见的遗传危险因素。除此之外，胆囊结石、胆囊的慢性炎症、胆囊息肉、胰胆管汇合处异常、胆道系统感染、肥胖症和糖尿病等，都是胆囊癌发病的高危因素。
胆囊癌虽然在临床上有一定的遗传因素存在，但是还有其它的综合因素也需要考虑。