脑脓肿对大脑的危害有很多，感染会造成脑组织的脓性病变，使患者出现颅内压增高，出现头痛、恶心、呕吐等症状。
脑脓肿多数的患者会伴随着视乳头水肿，如果是额叶的脓肿会伤害到很多神经功能，会导致患者神情淡漠或者人格的改变。如果是小脑的脓肿，伤害到人的运动功能，从而会造成共济失调。
另外，脓肿可能会造成大脑半球比较浅的脓肿，可能会引起癫痫的大发作，或者是局限性的发作。脑脓肿是一种危险的疾病，如果救治不及时，会造成脑组织死亡或者萎缩，使患者智力低下，并且留下很多后遗症。