胃肠功能紊乱是由于各种致病因素导致胃肠道的消化能力下降而引起的一系列症状，并不属于一种疾病的名称。
导致胃肠功能紊乱的病因，可能和胃肠道功能性疾病或器质性疾病有关。需要分清病因后进行对因对症治疗。
功能性疾病可能是由于饮食及精神因素等原因，导致胃肠道蠕动过快或缓慢，或者消化酶缺失等原因引起的一系列症状。一般建议选择调理脾胃的中成药，配合对症药物进行治疗。器质性疾病考虑和患者存在胃炎、肠炎、消化性溃疡等疾病有关。需要根据不同的病因选择不同的治疗方法。