药物性食管炎有可能会演变为癌症，但发生的几率较小。
假如患者的食管黏膜长期受到某些药物的刺激，出现充血、水肿、糜烂、溃疡时，发生癌变的几率会有所增加。同时，部分患者还可能会出现食管出血、食管狭窄、食管溃疡等并发症。
为了避免这一并发症的发生，选择用药治疗的过程当中，需要避免损伤食管黏膜的药物。同时也需要根据患者的疾病临床表现合理使用药物治疗，有条件时还可能需要到医院复查电子内镜，来观察疾病的恢复情况。