功能性消化不良是指由胃和十二指肠功能紊乱所引起的症状，而无器质性疾病的一组临床综合征。它是临床上最常见的一种功能性胃肠病，所以我们需要和一些疾病相鉴别。
比如食管胃和十二指肠的各种器质性疾病，如消化性溃疡、胃癌等。各种肝胆胰疾病；由全身性或其他系统疾病所引起的上消化道症状，比如糖尿病、风湿免疫疾病、肾脏病;还有一些精神神经疾病等;药物引起的上消化道症状，如服用非载体抗炎药;还有其他功能性胃肠病和动力障碍性疾病，如胃食管反流病、肠易激综合征。
因此，我们一定要进行仔细的鉴别。从临床诊断、特征以及查体，进一步来明确诊断。