阿米巴病应该到医院的传染科就诊，也可以到医院的消化内科就诊。如果有出现皮肤阿米巴病，可以到医院的皮肤科就诊。
因此，具体科室的选择，还需要根据患者的疾病临床表现以及医院的科室设置来决定。如果患者有出现腹胀、腹痛、腹泻以及寒颤、高热等症状，并且有出现穿孔等并发症时，也可能需要到医院的普通外科就诊。
如果有引起阿米巴肝脓肿等症状时，可以到医院的肝胆外科就诊。在就诊时需要详细告知医生的疾病发展过程，必要时需要手术治疗。