需要根据患者的病史、疾病临床表现以及病原学诊断来明确。
如果在患者的大便当中查到阿米巴病原体时，可以明确该疾病的诊断，这是该疾病诊断较为可靠的依据。尤其是同时患者有出现上腹部疼痛以及腹泻、寒战、高热等症状，并且食用了被阿米巴寄生虫污染的食物后，出现上述临床表现该疾病诊断更为明确。
为了明确该疾病是否有严重并发症的发生，还可能需要给患者做其他相关的辅助检查，比如结肠镜检查、X线钡灌肠检查。