先天性脑积水一般有以下几种原因导致：
第一，胎儿时期中枢神经发育异常就会阻碍脑脊液的流通，造成先天性脑积水。
第二，孕妇有感染性疾病，比如梅毒，就会容易引起胎儿脑组织发炎，从而造成先天性脑积水。
第三，先天性的脊柱裂、脑肿瘤等疾病会造成脑积水。轻度的先天性脑积水，可以使用抑制脑脊液分泌的药物治疗，比如甘露醇，严重的可以采取手术治疗。
针对于特别严重的先天性脑积水，会影响到胎儿的大脑发育，使胎儿出生后智力低下，甚至短期内死亡；所以在胎儿时期，医生会建议终止妊娠。