肢端肥大症严重时也往往不会截肢，截肢也并不能解决根本问题，肢端肥大症的治疗，往往需要针对垂体的生长激素腺瘤进行对因治疗，手术切除垂体腺瘤是首选的治疗方法，只有阻止血中生长激素继续增多，才能阻止病情继续发展，截肢没有必要。
除了手术治疗外，本病还可以通过药物治疗或者放射治疗来进行控制，对于垂体肿瘤过大手术无法施行，或者就是患者本身身体条件不适合手术治疗，可以选择进行药物治疗，而对于手术不能彻底根除的肿瘤，可以选择放射治疗，进一步控制病情。