贲门失弛缓症表现为胸痛以及食管炎、食管溃疡等疾病的临床表现。也可能会出现食管外的临床表现，疼痛的部位主要是胸骨后或者剑突下烧灼样疼痛，疼痛可以向颈部，背部放射；同时，也会出现反酸、吞咽困难以及吞咽疼痛，有可能会出现进食困难。
考虑到食管与气道紧密相连，因此食物反流后容易出现误吸，可能会导致患者出现咳嗽、咳痰，以及吸入性肺炎等疾病临床表现。该疾病出现了吞咽困难，因此有可能会影响营养物质的摄入，因此会导致患者出现体重下降、消瘦、营养不良性贫血。