有一部分亚甲炎的患者可能出现反复发作的情况。
亚甲炎是由病毒感染所导致的一组甲状腺疾病。患者发病时可以出现发烧、颈部不适、结节、疼痛从一侧转向另一侧。由于可能患病时累及到一侧甲状腺上半部分，所以，可能是颈部的上半部分疼痛转向另一侧，然后，又转回到本侧的下半部分甲状腺。所以，患者经常经历反复发烧甲亢的症状、甲减的症状，颈部疼痛持续存在，而且可以向耳后、下颌放射。
亚甲炎是病毒感染，具有自限性，整个病程大约是两到三个月左右。本次结束以后，也可能在下次发生病毒感染时，又导致亚甲炎的发作。这种情况在临床上是可以看到的，但是患病的人数并不是很多。